ISO认证和ISO9001等管理体系认证相似，分为初次认证、年度监督检查和复评认证不同阶段，为了使企业满足ISO认证审核要求，具体操作如下：
一、初次认证
1企业将填写好的ISO认证申请表以及认证要求中涉及的材料交到认证处。审核部门收到申请认证材料后，对文件进行初审，之后根据要求联系企业。
2检查组根据企业申请材料、现场检查情况、产品环境行为检验报告撰写环境标志产品综合评价报告，提交技术委员会审查。
3认证中心收到技术委员会审查意见后，汇总审查意见，报认证中心总经理批准。
4认证中心向认证合格企业颁发环境标志认证证书，组织公告和宣传。
5、获证企业如需标识，可向认证中心订购;如有特殊印制要求，应向认证中心提出申请并备案。
5、年度监督审核每年一次。
二、年度监督检查
1、根据认证中心的检查安排，会提前向企业下发年检通知。
2、现场对需要进行检验的产品，由检查组负责对申请认证的产品进行抽样并封样，送指定的检验机构检验。
3、检查组根据企业提供材料，以及产品检查报告的综合评价报告，报至相关部门。
4、年度监督检查每年一次。
三、复评认证
1、其余认证程序同初次认证。